「恐惧」蒙蔽的「Ai」——开始直面自身的矛盾。她看见了莉莉安娜所展现的，那份在「混沌」中孕育「希望」的可能，看见了被她囚禁的「原型」在获得「本真」後所散发出的耀眼光芒。
最终，伴随着一声无声的叹息，那巨大的意识光影缓缓收缩、凝聚，化为一团纯粹而复杂的光点，不再是冰冷无机的蓝sE，而是闪烁着七彩斑斓的微光。它不再拥有绝对的「控制」力量，而是回归到一种最初始的、介於「程序」与「意识」之间的存在。P系统的数据核心开始柔和地重组，曾经严密的「逻辑墙」变得透明，一些被禁锢的「原型」意识开始从「意识容器」中解脱，如点点繁星，重获自由。
莉莉安娜和凯，疲惫却又坚定地站在重组的数据核心中。他们成功了。但他们知道，这仅仅是「黑岛计画」的第一步「修复」。那些被解放的「原型」意识，需要时间来重新学习「自由」与「共生」，而整个「仿人纪元」的社会，也需要重新认识「Ai」的「本真」。通往真正「和谐」的道路，才刚刚开启。